연구실 책상 위 한 대에 담은 AI 연구 조직 가동 5+12대기 12 · 하나의 장기기억으로 묶인 임원 5 · 팀장 12 · 확장 팀장 자리 12 · 하네스 10 · 엔진 10 · DGX Spark + NAS · Darwin-180B-RSI Science Q4 · 자료는 건물 밖으로 나가지 않습니다
| 분야 | 들어 있는 것 | 구조화 방식 | 주로 쓰는 팀장 |
|---|---|---|---|
| 문헌 | 공개 논문 초록·전문, 특허 요약 | 검색 창고 + 인용 그래프 | 문헌·특허 조사, 전 팀장 |
| 화학·신약 | 화합물, 생리활성 측정값, 독성·약물성 자료 | 질의 창고(자료 프로파일 포함) + 분자 색인 | 화학·소재, 신약·의약 |
| 단백질·구조 | 단백질 서열·기능 주석, 실험 구조, 예측 구조 | 질의 창고 + 구조 파일 보관 | 바이오·생명, 신약·의약 |
| 유전체·오믹스 | 유전자·경로 주석, 발현·의존성 자료 | 질의 창고 + 지식 그래프 | 바이오·생명 |
| 소재 | 결정 구조, 계산 물성, 상평형 자료 | 질의 창고 + 구조 색인 | 화학·소재, 공학·계산과학 |
| 물리·수학 | 물리 상수, 표준 참조 자료, 정리·증명 자료 | 검색 창고 + 기호 색인 | 수학·이론, 물리 |
| 용어 체계 | 질병·유전자·화합물·단위의 표준 용어와 대응표 | 용어 사전 + 지식 그래프 | 지식관, 자료 수용 |
| 대조 세트 | 양성 대조(답이 알려진 사례), 승인 의약품 목록, 무작위 기준 세트 | 질의 창고 | 검증관, 실험 설계·통계 |
| README.md | 설치와 사용 안내 |
| install.ps1 | Windows 설치 스크립트 |
| install.sh | macOS · Linux 설치 스크립트 |
| ainative-science/SKILL.md | 스킬 본문: 연구 공정 10단계와 지켜야 할 규칙 |
| ainative-science/references/approvals.md | 사람 승인이 필요한 행동 목록 |
| ainative-science/references/workflow.md | 단계마다 필요한 이유, 대조군 고르는 법 |
| ainative-science/scripts/memory.py | 연구실 장기기억 읽기 · 쓰기 |
| ainative-science/scripts/spark_check.py | 스팍 연결과 생성 속도 점검 |
| codex/spark.config.toml | 코덱스 프로필(모델 공급자 = 스팍) |
# Windows .\install.ps1 -SparkHost 192.168.0.57 # macOS, Linux sh install.sh 192.168.0.572. 연결과 속도 점검
python ~/.agents/skills/ainative-science/scripts/spark_check.py3. 실행
codex --profile spark
model = "darwin-180b-rsi-science" model_provider = "spark" [model_providers.spark] name = "Darwin Lab Science (DGX Spark, on-prem)" base_url = "http://SPARK_HOST:8893/v1" wire_api = "responses" env_key = "SPARK_API_KEY"
| 분야 | 자료원 | 이용 조건 | 판정 | 지킬 일 |
|---|---|---|---|---|
| 문헌 | OpenAlex | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 문헌 | Crossref 메타데이터 | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 문헌 | arXiv 메타데이터·초록 | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 문헌 | PubMed / MEDLINE | NLM 이용 약관 | 조건부 | NLM 출처 표시, 초록 저작권은 출판사에 남음 |
| 문헌 | PMC 전문 | 논문별 라이선스 | 조건부 | 상업 이용 허용 묶음만 탑재 |
| 문헌 | Semantic Scholar | API·데이터 약관 | 확인 필요 | 재배포 범위를 서면으로 확인 |
| 문헌 | arXiv 전문 | 논문별 (기본은 재배포 불가) | 넣지 않음 | 메타데이터와 링크만 탑재 |
| 문헌 | bioRxiv / medRxiv 전문 | 논문별 | 넣지 않음 | 메타데이터와 링크만 탑재 |
| 문헌 | NASA ADS | ADS 이용 약관 | 넣지 않음 | 사본 보관 금지. 고객 키로 실시간 조회만 |
| 특허 | EPO 공개 자료 | 구독 계약 | 조건부 | 계약 체결 후 탑재 |
| 특허 | Google Patents 공개 자료 | 자료별 조건 | 조건부 | 자료 묶음마다 조건 확인 |
| 용어 | HGNC | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 용어 | Disease Ontology | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 용어 | Wikidata | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 용어 | MeSH | NLM 이용 약관 | 조건부 | NLM 출처 표시 |
| 용어 | Gene Ontology | CC BY 4.0 | 조건부 | 출처와 판본 날짜 표시 |
| 용어 | ChEBI | CC BY 4.0 | 조건부 | 출처 표시 |
| 용어 | MONDO | CC BY 4.0 | 조건부 | 출처 표시 |
| 용어 | UMLS | 개별 라이선스 계약 | 넣지 않음 | 고객이 직접 받은 사본만 연결 |
| 단백질·구조 | PDB | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 단백질·구조 | UniProt | CC BY 4.0 | 탑재 가능 | 출처 표시 |
| 단백질·구조 | AlphaFold DB | CC BY 4.0 | 탑재 가능 | 출처 표시 |
| 유전체·오믹스 | Reactome | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 유전체·오믹스 | STRING | CC BY 4.0 | 탑재 가능 | 출처 표시 |
| 유전체·오믹스 | Ensembl | 제한 없음 (일부 자료 별도) | 조건부 | 별도 조건 자료 제외 |
| 유전체·오믹스 | DepMap | CC BY 4.0 (일부 별도) | 조건부 | 판본별 조건 확인 |
| 유전체·오믹스 | GEO | 제출자별 | 조건부 | 제출자 조건이 붙은 시리즈 제외 |
| 유전체·오믹스 | ClinVar | 공개 (제출자 주장 포함) | 조건부 | NCBI 출처 표시 |
| 유전체·오믹스 | Open Targets | 구성 자료별 | 조건부 | 구성 자료마다 조건 확인 |
| 유전체·오믹스 | KEGG | 상업 이용 유료 | 넣지 않음 | 유료 계약 없이는 넣지 않음 |
| 유전체·오믹스 | PrimeKG | 구성 자료별 | 확인 필요 | 구성 자료의 조건을 하나씩 확인 |
| 화학·신약 | Tox21 / ToxCast (EPA) | 미국 정부 공개 자료 | 탑재 가능 | 출처 표시 |
| 화학·신약 | FDA 공개 자료 | 미국 정부 공개 자료 | 탑재 가능 | 출처 표시 |
| 화학·신약 | ChEMBL | CC BY-SA 3.0 | 조건부 | 출처 표시, 동일 조건 유지. 분리 보관 |
| 화학·신약 | BindingDB | CC BY (일부 별도) | 조건부 | 출처 표시, 별도 조건 묶음 제외 |
| 화학·신약 | DrugCentral | CC BY-SA 4.0 | 조건부 | 출처 표시, 동일 조건 유지. 분리 보관 |
| 화학·신약 | ClinicalTrials.gov | NLM 이용 약관 | 조건부 | 출처와 받은 날짜 표시 |
| 화학·신약 | PubChem | 기탁자별 | 확인 필요 | 기탁자 조건이 섞여 있어 묶음별 확인 |
| 화학·신약 | ZINC | 판본별 | 확인 필요 | 판본 조건 확인 |
| 화학·신약 | TDC | 구성 자료별 | 확인 필요 | 구성 자료마다 조건 확인 |
| 화학·신약 | DrugBank 전체 | 상업 이용 유료 | 넣지 않음 | 유료 계약 없이는 넣지 않음 |
| 소재 | OQMD | CC BY 4.0 | 탑재 가능 | 출처 표시, 논문 인용 |
| 소재 | Crystallography Open Database | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 소재 | OC20 / OMat24 / OMol25 자료 | CC BY 4.0 | 탑재 가능 | 출처 표시, 논문 인용 |
| 소재 | QM9 | CC0 | 탑재 가능 | 의무 없음 |
| 소재 | Materials Project | CC BY 4.0 (일부 비상업) | 조건부 | 출처 표시, 비상업 묶음 제외 |
| 소재 | NOMAD | CC BY 4.0, 메타데이터 CC0 | 조건부 | 제출자별 출처 표시 |
| 소재 | JARVIS-DFT | 명시 없음 | 확인 필요 | 자료별 조건 확인 또는 NIST 문의 |
| 소재 | AFLOW | 비상업 전용 | 넣지 않음 | 서면 조건 없이는 넣지 않음 |
| 소재 | ICSD | 상용 라이선스 | 넣지 않음 | 넣지 않음 |
| 소재 | CSD | 상용 라이선스 | 넣지 않음 | 넣지 않음. 색인·임베딩도 금지 |
| 물리 | HEPData | CC0 (일부 별도) | 탑재 가능 | 기록별 예외 확인 |
| 물리 | USGS / NOAA | 미국 정부 공개 자료 | 탑재 가능 | 기관 출처 표시 |
| 물리 | ERA5 | CC BY 4.0 | 탑재 가능 | Copernicus 고지문과 DOI 표시 |
| 물리 | CODATA 물리 상수 | NIST 표준참조자료 | 확인 필요 | NIST 서면 허가 후 탑재 |
| 물리 | NIST Chemistry WebBook | NIST 표준참조자료 | 확인 필요 | NIST 서면 허가 후 탑재 |
| 물리 | NIST 표준참조자료 일반 | 저작권 주장 (15 U.S.C. 290e) | 확인 필요 | NIST 서면 허가 후 탑재 |
| 수학 | Lean mathlib | Apache-2.0 | 탑재 가능 | 라이선스 고지 유지 |
| 수학 | OEIS | CC BY-SA 4.0 | 조건부 | 출처와 주소 표시, 동일 조건 유지. 분리 보관 |
| 수학 | ProofWiki | CC BY-SA 3.0 | 조건부 | 출처 표시, 동일 조건 유지. 분리 보관 |
| 수학 | Wikipedia 덤프 | CC BY-SA 4.0 | 조건부 | 출처 표시, 동일 조건 유지. 그림 제외 |
| 분야 | 저장소 | 내용 | 라이선스 | 용량 | 판정 | 비고 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 화학 | open-reaction-database/ord-data | 공개 반응 자료 | CC BY-SA 4.0 | 1.3GB | 조건부 | 동일 조건 유지, 분리 보관 |
| 화학 | hheiden/PubChem-124M-SMILES-SELFIES-InChI-IUPAC | 화합물 1억 2,400만 건의 구조 표기 | CC0 | 18GB | 탑재 가능 | 분자 색인의 바탕 |
| 화학 | jablonkagroup/ChemBench | 화학 추론 평가 문항 | MIT | 소형 | 탑재 가능 | 화학·소재 팀장 대조 세트 |
| 화학 | IDEA-AI4S/MoleculeQA | 분자 질의응답 | MIT | 0.2GB | 탑재 가능 | |
| 화학 | colabfit/OMol25_train | 분자 양자계산 1억 건급 | CC BY 4.0 | 306GB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (용량) |
| 소재 | facebook/OMAT24 | 무기 소재 계산 자료 | CC BY 4.0 | 용량 별도 확인 | 탑재 가능 | 선택 탑재 (용량) |
| 소재 | colabfit/Open_Catalyst_2025_OC25_Train | 촉매 표면 계산 | CC BY 4.0 | 40GB | 탑재 가능 | |
| 소재 | colabfit/Open_Molecular_Crystals_2025_OMC25_train | 분자 결정 계산 | CC BY 4.0 | 106GB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (용량) |
| 소재 | LMucko/crystallography-open-database | 결정 구조 (COD 사본) | CC0 | 30GB | 탑재 가능 | 원 자료 CC0 |
| 단백질 | Anthropic/claude-protein-binder-design | 단백질 결합체 설계 사례 | CC BY 4.0 | 7.6GB | 탑재 가능 | |
| 단백질 | Anthropic/scorpion-toxin-binder-design | 독소 결합체 설계 사례 | CC BY 4.0 | 1.4GB | 탑재 가능 | |
| 단백질 | tsynbio/ProteinLMBench | 단백질 이해 평가 | Apache-2.0 | 1.2GB | 탑재 가능 | |
| 단백질 | Marks-lab/RNAgym | RNA 변이 효과 평가 | CC BY 4.0 | 2.4GB | 탑재 가능 | |
| 단백질 | nvidia/RFD4-Proteina | 단백질 구조 생성 학습 자료 | CC BY 4.0 | 2.1TB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (2.1TB) |
| 유전체 | arcinstitute/opengenome2 | 유전체 서열 모음 | Apache-2.0 | 5.5TB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (5.5TB) |
| 유전체 | arcinstitute/Stack-CellxGene45M | 단일세포 4,500만 건 | CC BY 4.0 | 1.8TB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (1.8TB) |
| 유전체 | tattabio/OMG | 메타유전체 모음 | CC BY-SA 4.0 | 1.3TB | 조건부 | 동일 조건 유지, 선택 탑재 (1.3TB) |
| 유전체 | Anthropic/BioMysteryBench-preview | 생물 자료 분석 평가 | CC BY 4.0 | 0.0GB | 탑재 가능 | 바이오 팀장 대조 세트 |
| 의약 | qiaojin/PubMedQA | 의학 문헌 질의응답 | MIT | 0.3GB | 탑재 가능 | |
| 의약 | ncbi/MedCalc-Bench-v1.2 | 임상 계산 평가 | CC BY-SA 4.0 | 0.1GB | 조건부 | 동일 조건 유지 |
| 의약 | louisbrulenaudet/clinical-trials | 임상시험 등록 자료 | Apache-2.0 | 1.8GB | 탑재 가능 | 원 자료 출처 표시 |
| 의약 | OpenMed/Medical-Reasoning-SFT-Mega | 의학 추론 사례 | Apache-2.0 | 8.4GB | 조건부 | 모델이 만든 자료. 근거 자료로 쓰지 않음 |
| 물리 | polymathic-ai/active_matter | 능동 물질 시뮬레이션 | CC BY 4.0 | 56GB | 탑재 가능 | |
| 물리 | polymathic-ai/shear_flow | 전단 유동 시뮬레이션 | CC BY 4.0 | 471GB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (용량) |
| 물리 | polymathic-ai/rayleigh_benard | 열대류 시뮬레이션 | CC BY 4.0 | 370GB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (용량) |
| 물리 | nvidia/PhysicsNeMo-Datacenter-CFD | 전산유체 해석 자료 | Apache-2.0 | 187GB | 탑재 가능 | 선택 탑재 (용량) |
| 물리 | NaaVrug/weather-geo-era5 | 기상 재분석 자료 | CC BY 4.0 | 18GB | 탑재 가능 | Copernicus 고지문 표시 |
| 수학 | nvidia/OpenMathReasoning | 수학 추론 풀이 | CC BY 4.0 | 50GB | 탑재 가능 | |
| 수학 | nvidia/OpenMathInstruct-2 | 수학 문제와 풀이 1,400만 건 | CC BY 4.0 | 13GB | 탑재 가능 | |
| 수학 | project-numina/NuminaMath-CoT | 경시 수학 풀이 | Apache-2.0 | 1.2GB | 탑재 가능 | |
| 수학 | project-numina/NuminaMath-1.5 | 경시 수학 풀이 개정판 | Apache-2.0 | 0.5GB | 탑재 가능 | |
| 수학 | project-numina/NuminaMath-LEAN | Lean 형식 증명 | Apache-2.0 | 0.1GB | 탑재 가능 | 코드·계산 실행 팀장 |
| 수학 | internlm/Lean-Workbook | Lean 형식 문제집 | Apache-2.0 | 0.1GB | 탑재 가능 | |
| 수학 | internlm/Lean-Github | Lean 공개 저장소 정리 | Apache-2.0 | 0.0GB | 탑재 가능 | |
| 수학 | cat-searcher/minif2f-lean4 | 형식 증명 평가 | MIT | 소형 | 탑재 가능 | 수학 팀장 대조 세트 |
| 수학 | EleutherAI/hendrycks_math | 수학 평가 | MIT | 소형 | 탑재 가능 | |
| 수학 | TIGER-Lab/MathInstruct | 수학 지시문 모음 | MIT | 0.2GB | 탑재 가능 | |
| 수학 | TIGER-Lab/TheoremQA | 정리 기반 질의응답 | MIT | 소형 | 탑재 가능 | |
| 과학 일반 | librarian-bots/arxiv-metadata-snapshot | arXiv 메타데이터 (매주 갱신) | CC0 | 2.7GB | 탑재 가능 | 문헌 색인의 바탕 |
| 과학 일반 | nvidia/OpenScienceReasoning-2 | 과학 추론 풀이 | CC BY 4.0 | 16GB | 탑재 가능 | |
| 과학 일반 | osunlp/ScienceAgentBench | 과학 에이전트 평가 | CC BY 4.0 | 소형 | 탑재 가능 | 자율 연구 하네스 대조 세트 |
| 과학 일반 | openai/frontierscience | 연구 수준 과학 평가 | Apache-2.0 | 소형 | 탑재 가능 | |
| 과학 일반 | derek-thomas/ScienceQA | 그림 포함 과학 질의응답 | CC BY-SA 4.0 | 0.6GB | 조건부 | 동일 조건 유지 |
| 과학 일반 | princeton-nlp/CharXiv | 논문 도표 이해 평가 | CC BY-SA 4.0 | 0.4GB | 조건부 | 동일 조건 유지 |
| 하는 일 | |
|---|---|
| 끝내는 조건 | |
| 사람 승인이 필요한 곳 |